limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思？

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做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？

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为什么用prokka注释完，都是假设蛋白质

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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featureCounts assigned reads率低，正常吗？

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为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图

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问 生信

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问 使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据

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