请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1798: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？: 2645 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？: 1216 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？: 2252 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框: 2197 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

limma中的Removing heteroscedascity from count data和拟合线性模型是什么意思？: 1216 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

老孟你今答题效率逆天啊，连续几个都是你在答～: 2685 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系: 2200 浏览 2 关注 2 回答 1 评论

GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？: 2883 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况: 2933 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

第二代测序碱基出错偏向的原因是什么为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主稀有碱基会影响测序吗: 2617 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 KEGG结果为空？: 3505 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 3518 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025