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什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系

转录组比对

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:17

楼上你说的……有点问题的…… [size=14]normalized read count 主要是对测序量进行校正，比如1个case测了10M，1个case测了20M。最简单的办法就是直接对case 2 除以2，但是真实算的时候不是这么算的，有不同的方法。理由是，基因的表达量不是线性变化的。[/size]

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小赛尔注册会员用户来自于: 广东省
2018-09-07 23:27

已解决，normalized read count是read除以片段长度除以总read数，与RPKM可直接换算。

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: 小赛尔 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-09-07 13:13

更新时间: 2018-09-08 10:17

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