差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2275: 浏览

差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析

软件使用

这个软件最后生成几个TXT文件这些文件里的内容怎么分析啊怎么看样本可变剪切情况啊？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-28 15:52

我建议你先了解一下这几个表的每一列都代表什么意思。然后再学习一下怎么画sashimiplot。最后，用rMATS官方的工具先画一些sashimiplot，之后就可以看了。对了，多说一句，rMATS计算出来的表格里面，已经给出了是否显著的信息~

赞同 2 0评论

关于作者

: jiamin_2018 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-28 15:47

更新时间: 2018-08-28 15:52

关注人数: 2 人关注

相关问题

关于生存分析的问题: 1221 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。: 3149 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？: 5303 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

宏基因组进行binning分析: 2964 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？: 1941 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？: 2687 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

无参基因组分析GO富集到了这一步不会做: 1198 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因: 2686 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 3519 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

噬菌体比较基因组分析流程: 2290 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问从bed文件获取注释: 3150 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map: 1319 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC: 2406 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 oh my zsh怎么配置: 1115 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 cafe 结果可视化如何操作？: 1894 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025