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jiamin_2018
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jiamin_2018
在 2018-09-17 20:27 发起了提问
stringtie
问答
stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID
孟浩巍
:
你现在貌似还没有做gffcompare,看一下stringtie的处理流程: [attach]230[/attach]
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jiamin_2018
在 2018-09-13 15:28 发起了提问
stringtie与DESeq2
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stringtie 与DESeq2
stringtie 与DESeq2 数据分析
:
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jiamin_2018
在 2018-08-29 14:51 发起了提问
digeo
问答
最近在测试有一个可变剪切的软件,听说比rmats效果好
孟浩巍
:
2017年新的软件,还没有试过。 之前我们用rMATS的结果挺好的,能够和实验结果match。目前我还是推荐用rMATS,毕竟这么多人检验过。
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jiamin_2018
在 2018-08-28 15:47 发起了提问
软件使用
问答
差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析
孟浩巍
:
我建议你先了解一下这几个表的每一列都代表什么意思。 然后再学习一下怎么画sashimiplot。 最后,用rMATS官方的工具先画一些sashimiplot,之后就可以看了。 对了,多说一句,rMATS计算出来的表格里面,已经给出了是否显著的信息~
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