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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-06-18 20:45

一般这种就是非常典型的动态调控,常用的有下面几种做法:

1. 可以先把差异基因都找出来,然后做个heatmap

2. 把高变基因做个PCA看高权重基因;

3. 尝试WGCNA,类似可参考这篇paper (https://www.nature.com/articles/nature12364)

其中就是利用WGCNA解决每个发育时期的响应基因的。

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发布时间
2023-06-18 16:02
更新时间
2023-06-18 20:45
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