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单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？

单细胞RNA_seq

如题，我在做umap聚类的时候，4群是单独在外面的一群，其实我们在生物学上很确定这一群不应该单独在外面，应该和5群更紧密地贴在一起，请问，在seurat或者scanpy中有什么参数可以调整4群让他贴着5群吗？

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笨阿牛初级会员用户来自于: 上海市徐汇区
2023-06-06 17:58

可以修改你的UMAP坐标，其实就是XY轴的信息，调整到你满意。

带着这个坐标做velocity分析，即可。

可能有点造假，但是我称为半监督聚类，嘿嘿。

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发布时间: 2023-06-06 14:56

更新时间: 2023-06-07 20:35

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