RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？

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如何在差异表达前消除批次效应

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seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？

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请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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Harmony 和Seurat的FindIntegrationAnchors算法各有何优劣

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二代转录组去除批次效应

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问 samtools view筛选cellranger比对结果

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问 在做RNA Velocity的时候增殖细胞群总是起点

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问 seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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问 pseudobulk分析

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问 运行harmony后counts数变成小数

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问 空转bin_size

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问 infercnv运行报错

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问 单细胞转录因子

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问 ​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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