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harmony处理批次效应

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前台管理员 用户来自于: 北京市
2023-05-25 13:53

个人建议是,在做样本合并之前,先对每个样本单独进行FindVariableFeatures,得到每个样本的高变异基因(hvf),而后取样本hvf的并集,作为后续合并完成的SeuratObject的hvf,这样可以保证每个数据集的差异特征尽可能的保留。而后,再对合并完成的SeuratObject进行ScaleData和RunPCA的操作,然后再RunHarmony进行批次效应矫正。

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发布时间
2023-05-23 15:44
更新时间
2023-05-25 13:53
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