该问题已被锁定!
2
关注
2688
浏览

3D基因组里,如何分清compartment、TAD和chromatin loop

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-05-23 09:41

这3者的尺度一般意义上是不同的。

compartment主要是Mbp级别的尺度,一般单compartment也要10Mbp这个单位;

TAD主要是染色体内部的一个联系紧密区域,一般认为尺度在几百Kbp ~ Mbp范围;

loop尺度更小,更强调小范围内引起的互作。

关于作者

song 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-05-22 21:51
更新时间
2023-05-23 09:41
关注人数
2 人关注

相关问题

请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义
如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?
SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
如何判断GO号的层级?
无参基因组分析GO富集到了这一步不会做
EVEs和HGTs之间关系如何
在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下,如何利用cuffdiff进行差异基因分析。
【求助】如何确定时期特定表达基因
如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥)

推荐内容

请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值
how to speed up following code 
请问cytoscape是怎么构建网络的?
如何批量下载SRA数据库中的数据?
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值
de novo mutation检测和判断
关于生存分析的问题
SPSS报错
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025