细菌基因组分析

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关于生存分析的问题

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请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？

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转录组组内样本差异大

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常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

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16s rRNA分析中的标准化

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GAPIT包FarmCPU和Blink模型进行GWAS分析报错

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宏病毒组做binning分析

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非已知转录因子预测

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 转录组定量结果为0

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 转录组测序问题

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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