how to speed up following code - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2240: 浏览

how to speed up following code

生信问题

how to speed up following code

switch(base){
        case 'A':
            return 0;
        case 'T':
            return 1;
        case 'C':
            return 2;
        case 'G':
            return 3;
        default:
            return -1;
    }

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-05-22 20:29

为了加速以下代码，建议使用查表法（Look-up Table，LUT）来代替switch case语句。将每个碱基与其对应的数字进行映射，可以通过查表来快速找到碱基所对应的数字。以下是一个示例代码： ```python # 创建查表字典 lut = { 'A': 0, 'T': 1, 'C': 2, 'G': 3 } # 定义函数，使用查表法来代替switch case语句 def base_to_num(base): return lut.get(base, -1) ``` 使用查表法可以大幅提高代码的速度，因为它可以避免在程序运行时进行判断和分支操作。同时，使用查表法还可以让代码更清晰易懂，易于维护。

赞同 0 0评论

关于作者

: Kim 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2023-05-22 20:02

更新时间: 2023-05-22 20:29

关注人数: 2 人关注

相关问题

根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff: 1530 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？: 3102 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

GATK和Samtools联合寻找变异: 3302 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

epigenome editing tools: 2866 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Identification of Missing Genes in Rice Annotation by Histone Modifications 怎么理解这段？: 2146 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 2829 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问cytoscape是怎么构建网络的？: 2089 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

ROSE包分析Super Enhancer: 2943 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题: 4135 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation: 3793 浏览 4 关注 3 回答 1 评论

推荐内容

问 kraken2软件运行时内存分配的问题: 4744 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问 logistic回归、异常值: 2550 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？: 2066 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问cytoscape是怎么构建网络的？: 2089 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？: 2379 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 1379 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

问 GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？: 3296 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Ancestry_hmm: 1470 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）: 2700 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026