RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1862: 浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

生信问题

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11

因为测序的时候是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上，所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上。但是如果是circRNA被测序到，这个测序就会出问题，就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况，当出现这种情况的时候，就是你要的circRNA序列。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-05 12:49

更新时间: 2018-09-05 13:11

关注人数: 2 人关注

相关问题

基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 1069 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

问一个关于miRNA ID的问题: 1325 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值: 1742 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

给我一份最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集: 2241 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？: 1585 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？: 2328 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

16s rRNA分析中的标准化: 1477 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1791 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？: 1679 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

Chip-seq bam文件的处理: 2957 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问关于基因间的相关性分析: 2303 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？: 2694 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 SPSS报错: 2024 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 SPSS报错: 2338 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 cellranger使用问题: 2777 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 rna-seq数据校正: 2096 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 2117 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 logistic回归、异常值: 1912 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值: 2913 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？: 2698 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025