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在 2018-09-28 08:45 回答了问题
存储
bas.h5
pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了?
xsp
:
我用vdb-dump解出来了PacBio的SRR1924430的完整的sra文件,emmm,内容很多,比fastq大很多,格式应该是同bas.h5相同或类似。一个sra文件大概能解出来十倍大的fastq(当然,不是我们熟知的fastq,我只是不知道应该管他叫啥,可能就是bas.h5吧)。如图 [a...
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在 2018-09-25 17:19 发起了提问
数据处理
问答
SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致
从SRA下载了SRR194430.sra文件,fastq-dump转为fastq时,出现如下情况 [attach]267[/attach] 不知其因,所以又从EBI下载了SRR1924430的fastq文件,结果,emmm,EBI的fastq文件就是sra转了一部分的那个fastq文件。两个文件都...
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在 2018-09-25 14:17 发起了提问
存储
bas.h5
问答
pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了?
孟浩巍
:
h5格式是带原始信号的,fastq只有质量值和序列信息,当然小很多。
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在 2018-09-17 14:03 回答了问题
生信分析
生信问题
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
xsp
:
看文献啊,pubmed搜你网络里节点类型的关键词(例如mRNA,lncRNA,network),大把的文献可以参考。
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在 2018-09-07 14:41 发起了提问
下载
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axel,wget下载数据出错的问题,没头绪
笨阿牛
:
这个问题没有答案吗? Amazing!!! 有没有试过wget的时候,用断点继续下载的方式:wget -b -c -i [url=http://www.http://?]www.http://?[/url] 然后看一下wget.log,看你的下载是否是100%的。
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在 2018-08-22 17:27 发起了提问
没事找事
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论单身的重要性
孟浩巍
:
单身狗一般都能做出牛逼的科研!
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