xsp 注册会员

这家伙还没有留下自我介绍
保密
关注: 2    |    粉丝: 1    |    积分: 2075    |    威望: 0    |    访问: 1077
xsp 在 2018-09-28 08:45 回答了问题
存储 bas.h5
pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了？
xsp: 我用vdb-dump解出来了PacBio的SRR1924430的完整的sra文件，emmm，内容很多，比fastq大很多，格式应该是同bas.h5相同或类似。一个sra文件大概能解出来十倍大的fastq(当然，不是我们熟知的fastq，我只是不知道应该管他叫啥，可能就是bas.h5吧)。如图 [a...
xsp 在 2018-09-25 17:19 发起了提问
数据处理
问答 SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致
从SRA下载了SRR194430.sra文件，fastq-dump转为fastq时，出现如下情况 [attach]267[/attach] 不知其因，所以又从EBI下载了SRR1924430的fastq文件，结果，emmm，EBI的fastq文件就是sra转了一部分的那个fastq文件。两个文件都...:
xsp 在 2018-09-25 14:17 发起了提问
存储 bas.h5
问答 pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了？
孟浩巍: h5格式是带原始信号的，fastq只有质量值和序列信息，当然小很多。
xsp 在 2018-09-17 14:03 回答了问题
生信分析 生信问题
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？
xsp: 看文献啊，pubmed搜你网络里节点类型的关键词（例如mRNA，lncRNA，network），大把的文献可以参考。
xsp 在 2018-09-07 14:41 发起了提问
下载
问答 axel，wget下载数据出错的问题，没头绪
笨阿牛: 这个问题没有答案吗？ Amazing！！！ 有没有试过wget的时候，用断点继续下载的方式：wget -b -c -i [url=http://www.http://?]www.http://?[/url] 然后看一下wget.log，看你的下载是否是100%的。  
xsp 在 2018-08-22 17:27 发起了提问
没事找事
问答 论单身的重要性
孟浩巍: 单身狗一般都能做出牛逼的科研！
个人成就
获得 2 次赞同
被 1 人关注了
关注了 2 人
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024