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pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了?
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pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了?
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bas.h5
测序数据难道不应该尽量节省存储空间吗?为什么我把pacbio的bas.h5文件转为fastq文件后,反而变小了?bas.h5格式文件有什么优势吗?
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孟浩巍
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用户来自于: 北京市
2018-09-25 14:20
h5格式是带原始信号的,fastq只有质量值和序列信息,当然小很多。
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xsp
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用户来自于: 俄罗斯
2018-09-28 08:45
我用vdb-dump解出来了PacBio的SRR1924430的完整的sra文件,emmm,内容很多,比fastq大很多,格式应该是同bas.h5相同或类似。一个sra文件大概能解出来十倍大的fastq(当然,不是我们熟知的fastq,我只是不知道应该管他叫啥,可能就是bas.h5吧)。如图 [attach]271[/attach] [attach]272[/attach]
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xsp
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-25 14:17
更新时间
2018-09-28 08:45
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