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i_thinking 在 2018-10-11 16:58 回答了问题 hichip: Hichip得到loop数据如何注释？; i_thinking: 谢谢，孟老师。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

i_thinking 在 2018-10-11 15:05 发起了提问 hichip: 问答 Hichip得到loop数据如何注释？

孟浩巍: 最常用的注释软件是homer软件里面的annotationPeaks，我建议你去看一下下面的链接。注释的信息非常完整。 [url]http://homer.ucsd.edu/homer/ngs/annotation.html[/url]; 关注问题 2  0  0 评论

i_thinking 在 2018-09-27 15:04 回答了问题 生信问题: rna-seq数据校正; i_thinking: 好的，感谢孟老师; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

i_thinking 在 2018-09-26 09:49 发起了提问 生信问题: 问答 rna-seq数据校正

孟浩巍: 一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。; 关注问题 2  2  0 评论

匿名用户在 2018-09-26 09:47 回答了问题 DESe2: 关于DESeq2样本聚类的问题; i_thinking: 请问是同一批数据吗？有没有做过标准化？; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

i_thinking 在 2018-09-20 10:27 发起了提问 homer motif分析: 问答 homer

老铁们，找完motif，如何筛选可信的motif呢？谢谢:; 关注问题 1  0  0 评论

i_thinking 在 2018-09-03 18:27 发起了提问 htseq: 问答 HTseq gtf文件的选择

tick: [url]https://www.gencodegenes.org/releases/grch37_mapped_releases.html[/url]; 关注问题 3  3  0 评论

i_thinking 在 2018-08-24 15:18 回答了问题 问题求解 R heatmap 聚类分析: 用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图; i_thinking: 文章里的km应该是6.; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 3 回复

i_thinking 在 2018-08-24 11:12 回答了问题 edgeR 批次效应 差异表达: 如何在差异表达前消除批次效应; i_thinking: 可以试试deseq2; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

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