sc-ATAC数据质控

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RNA-seq logFC与pvalue

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数据不平衡

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HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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对于BLAST算法在高歌老师的课上提到运用哈希函数和有限自动机的模型去提高数据检索效率，不是很理解其中的原理，希望得到大神们的帮助

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如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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RNA-seq差异分析

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prokka数据库更新

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 how to speed up following code 

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问 HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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问 computeMatrix画图问题

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问 3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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问 基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？

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问 L1插入位点的百分比密度分布

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问 juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？

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问 sc-ATAC数据质控

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