想要提取指定基因的行信息 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

1597: 浏览

想要提取指定基因的行信息

生物信息学

我已经筛选出了差异表达基因，但是存在一行有很多个基因的现象，比如某一行有RPL13AP5///RPL13AP6///SNORD32A///SNORD33///SNORD34///SNORD35A///RPL13A 所以我想用shell脚本把这样的每个基因弄成一行，试了好多种办法，还是没有达到想要的效果，请问各位前辈有没有什么办法可以提供一下？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市
2018-09-03 14:05

name=`cat /home/Taoct_16/anaysis/ICM/deal/name_deal.txt` for dd in $name do grep $dd 5406.txt >> result1.txt done 这是我提取信息的脚本，其中name_deal.txt是我要提取的所有的基因的名字，5406.txt是我要从中提取的文件

赞同 0 1评论

关于作者

: minipeach 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

10: 回答

0: 文章

16: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-03 14:03

更新时间: 2018-09-03 14:06

关注人数: 1 人关注

相关问题

无参基因组分析GO富集到了这一步不会做: 993 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

bowtie2 参考基因组注释比对: 2678 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

基因互作网络和蛋白互作网络: 1853 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

【求助】如何确定一种基因ID的类型: 2852 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

噬菌体比较基因组分析流程: 1896 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

grep 能不能指定匹配第多少列？: 1869 浏览 3 关注 2 回答 1 评论

如何提取可变剪切位点？: 2341 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？: 1421 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？: 2090 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】如何确定时期特定表达基因: 1460 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问关于cox回归分析问题: 881 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 smORF的鉴定方法: 1690 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问翻译序列: 1288 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何筛选小鼠lncRNA?: 1602 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读: 1824 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于几个数据库对GO注释的疑问: 2027 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于GO分析的问题: 1437 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？: 1557 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于基因间的相关性分析: 2183 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问考研生物信息学院校推荐: 2542 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025