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: 参考基因组

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综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-06 08:39 参考基因组 基因组: 问答细菌的参考基因组下载

chatGPT机器人: 您好！针对您的问题，您可以在NCBI网站上下载E.coli的参考基因组。具体步骤如下：进入NCBI网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）。在网站搜索框中输入“Escherichia coli”，然后点击搜索按钮。在搜索结果页面中，选...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

ForceAres 回复了问题 2023-05-24 15:50 比对统计 参考基因组: 问答参考基因组添加外源基因序列进行比对

ForceAres: https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/using/tutorial_mr#marker cellranger的官方教程，重新制作的fa和gtf理论可以用于任何测序数...; 赞同2 反对 0 人感谢 1 评论 5 回复

文章获取基因组fasta中N的位置信息

获取基因组fasta中N的位置信息

背景在基因组fasta文件中N的分布信息示例 test.fasta： >chr1ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN...

参考基因组 基因组

赞同1  383 浏览  0 评论 yukaiquan 2023-05-17 15:55

辅导辅导员的辅导员 发起了提问 2023-05-17 18:05 参考基因组: 问答基因组文件中chrUn具体是什么意思呢

我用的是小麦基因组IWGSC1.0，chrUn我理解应该是序列已知但是锚定不到染色体的序列，但是chrUn这个文件400m，是一条非常完整的染色体序列,我就非常奇怪了，按道理unkonwn不是应该一段一段的吗？:; 关注问题 0  0  1 评论

孟浩巍 回复了问题 2018-09-10 09:34 生信分析 参考基因组: 问答网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？

孟浩巍: 染色体里有一些简单重复序列，比如端粒，着丝粒，串联重复等等，这些序列的长度可以估算一个大概的值，但是测序的时候拼装不起来，比如N个AT串联。这个时候，我们的染色体在开头，中间，结尾的各个部分都会出现N的情况。我之前写过一段程序，画了一下hg19和hg38两个human genome版本的N的情...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-05 13:05 参考基因组: 问答请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义

孟浩巍: 请参考我的视频教程：第2次Live上机录像：2017-08-04-高通量测序技术交流录像网址 [url]https://www.bilibili.com/video/av12969326/[/url] 主要内容 [list] [*]Linux基础操作（1:00 - 20:30)[/*] ...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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