rMATS是如何得到外显子的两种isform的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1417: 浏览

rMATS是如何得到外显子的两种isform的？

可变剪切

rMATS比较差异是通过比较exon inclusion level 而exon inclusion level是通过exon skipping 和inclusion 两种isform计算的，那么这两种isform是怎么得到的呢？一条reads一条reads的去数嘛？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:22

rMATS检测的可变剪切主要分成下面5种： [attach]165[/attach] 在检测的时候，需要提供gtf文件，然后通过判断read跨越junction的情况来判断。就是1条reads，1条reads的去数。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-07 12:01

更新时间: 2018-09-08 10:22

关注人数: 2 人关注

相关问题

mac如何打开Google的网页？: 1705 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

【求助】如何确定一种基因ID的类型: 2291 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

请问如何查询某基因的详细的Biological Function？: 1161 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping: 1699 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

【求助】在Ubuntu如何上网: 2427 浏览 6 关注 5 回答 0 评论

二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 1598 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算: 1760 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

ubuntu 14.04 server版安装软件 biocLite("highthroughputassays")，出现如下报错如何解决呢？: 1285 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？: 1872 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件: 3525 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？: 1473 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025