该问题已被锁定!
2
关注
2435
浏览

如何理解单细胞测序中用fastQC对低质量细胞进行过滤

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 09:19
是这样滴,FastQC只能生成质量报告,不能够设置参数进行处理。 你这里面提到的mapping ratio,mapping gene ratio等等都需要自己再后续计算,和FastQC关系不大。 我建议你看一下我们之前zhihu专栏里写的关于FastQC的报告解读。   另外,单细胞现在有各种完整的工具包去做这些事情,不用担心,现在都已经流程化了。

关于作者

问题动态

发布时间
2018-09-05 09:13
更新时间
2018-09-05 09:19
关注人数
2 人关注

相关问题

如何提取可变剪切位点?
群体进化,重测序,选择分析
原核生物的转录组测序为什么比真核的贵?
Affy包中的MAplot函数的作用是什么?画出的MAplot图如何解读?为何要进行MAplot检查?
perl的如何进行读取和循环的
生信到底如何入门???
无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因
sgRNA的GC content 是什么意思,该如何计算
为什么单端测序的数据解压会出现多个文件?
统计学,如何从入门到放弃?

推荐内容

cellranger运行结果分析
单细胞seurat对象的基因过滤
smart-seq2样本质检报告说有小片段,请问那还可以建库么?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025