如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads

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RNA-seq比对region：exonic/intronic/intergenic 比例异常

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用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？

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bowtie2比对结果报告best，以及aligned concordantly

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reads比对的统计

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参考基因组添加外源基因序列进行比对

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corrplot报错

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Stringtie报错

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ubuntu 14.04 server版安装软件 biocLite("highthroughputassays")，出现如下报错如何解决呢？

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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问 chipseq中一共一般有多少峰，可以认为实验是比较靠谱的呢

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问 narrowPeak中的qvalue可否用于信号强弱的参数

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问 chromosome名称转换

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