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用了一篇文章的数据做转录组分析,文章网址(https://www.nature.com/articles/nsmb.2679)
用hg19进行比对,gencode.v43lift37.annotation.gtf.gz进行计数。然后用DESeq2进行分析。挑选了P<0.05,倍数超过1倍的基因进行后续操作。clusterProfiler进行分析,结果得到的KEGG和GO结果是空的,里面一个富集的都没有,想知道为什么?还是说这是正常现象?
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大概率是你输入的gene list名字就有问题。
建议先检查一下gene list的名字。
这家伙很懒,还没有设置简介
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