R进行GO时出现No gene can be mapped.... - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

2879: 浏览

R进行GO时出现No gene can be mapped....

根据孟叔的视频进行拟南芥的GO分析，得到的结果如下，请小伙伴告诉我只哪里出问题了 [attach]6[/attach] [attach]7[/attach]

好问题 0 评论收藏举报

3 回答

jailyn 前台管理员用户来自于: 广东省广州市
2018-08-23 14:47

修改成为“ENTREZID” 之后还是一样的问题。 --> No gene can be mapped.... --> Expected input gene ID: 818055,837839,839140,831727,832825,839243 --> return NULL...

赞同 1 4评论

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-23 14:43

是不是你的gene_id 没有设置好啊？ entrez_id是数字，SYMBOL的意思是基因名，你在进行map的时候这两个要对应。我看你的代码，貌似一个是entrez id 一个写成SYMBOL了。

赞同 0 1评论

fcdslz 超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-23 14:45

老哥你直接把代码贴上来吧，我们看起来方便点。 ------------------------------------------------------------------你的KeyTYPE错了，应该设置为ENTREZ 的那个type，现在的代码是用SYMBOL类型的数据与你自己的ENTREZ的数据进行匹配，肯定没结果的。

赞同 0 1评论

关于作者

: jailyn 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

7: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-23 14:41

更新时间: 2018-08-23 14:58

关注人数: 3 人关注

相关问题

RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？: 1954 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

关于对3dDNA产生的hic文件进行纠错的问题: 2562 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

我用admixture进行群体结构的时候，为什么做出来到K=1到11中K=9最小，但是到K=12之后又更小了: 3009 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 2654 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Identification of Missing Genes in Rice Annotation by Histone Modifications 怎么理解这段？: 1973 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

不同种群的the overall synonymous diversity (πS)是什么意思: 2109 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

snakemake运行时出现的错误: 2336 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？: 2091 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？: 2243 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

monocle3中plot_cells更改其画出来的细胞群的颜色: 4363 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 3869 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问请问无参转录组的GO分析如何进行: 4058 浏览 7 关注 6 回答 0 评论

问科研/读博: 2852 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 GEOquery下载GEO数据软件报错: 4356 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问画heatmap出现错误提示: 1777 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图: 2221 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？: 2627 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 3249 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 KEGG结果为空？: 3819 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026