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RIP-seq有没有类似ChIP-seq的blacklist region合集?

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-06-05 20:45

ChIP-seq,ATAC-seq可能会用到black list,是因为基因组上有一些比较特殊的区域,有可能会被抗体非特异富集,或者是一些simple repeat区域,容易造成call peak的假阳性。所以需要搞个black list去做个过滤。

但是m6A-seq都确定是转录组上的东西了,肯定都是基因区的peak啊,所以black list意义不大。

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发布时间
2023-06-05 16:53
更新时间
2023-06-05 20:45
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