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我在进行单细胞测序的时候,想区分不同来源的肿瘤细胞,因此在一类细胞中外源导入GFP,另一类中导入Luciferase,且我已知这些基因的序列。在完成测序并获得原始数据后,是否应该在参考基因组中添加这一列外源基因的序列进行index和比对?如果理论上可行的话,实际应该如何操作?直接在fa文件中添加新的chr和序列吗?请大家帮我出出主意,谢谢!
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直接把你的序列cat进去再索引一次就好了,具体你可以参考这个文献:
这家伙很懒,还没有设置简介
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