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我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

转录组

华大云平台返回来的FPKM值好大啊看一下这个合理吗？

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-05-20 16:13

有一些组成型的基因表达量就是很高，这个是okay的。

如果你对这个结果怀疑，我建议你做下面2件事情：

他们应该也会给你raw count的矩阵，你拿着这个raw count矩阵，看看里面对应的数值，是不是也很大，把raw count矩阵里的单样本加和，看看是不是合理的测序量；
下载BAM文件，用IGV看看这几个基因的count是不是很多。

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发布时间: 2023-05-19 15:37

更新时间: 2023-05-20 16:13

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