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我测了一批寄生蜂的转录组样品,FPKM值感觉好奇怪,合理吗?

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-05-20 16:13

有一些组成型的基因表达量就是很高,这个是okay的。

如果你对这个结果怀疑,我建议你做下面2件事情:

  1. 他们应该也会给你raw count的矩阵,你拿着这个raw count矩阵,看看里面对应的数值,是不是也很大,把raw count矩阵里的单样本加和,看看是不是合理的测序量;
  2. 下载BAM文件,用IGV看看这几个基因的count是不是很多。

 

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发布时间
2023-05-19 15:37
更新时间
2023-05-20 16:13
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