EVM整合基因组注释

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细菌基因组分析

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单细胞转录因子

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在用seurat做多样本整合的时候的问题

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由cutesv流程鉴定到的SV有特别多的缺失基因型

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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群体内同源基因的所有变异

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？

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问 harmony处理批次效应

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问 samtools view筛选cellranger比对结果

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问 harmony整合样本前需要分别预处理吗？

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问 单细胞monocle3，路径很不对，有什么参数是值得调的吗

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问 monocle3中plot_cells更改其画出来的细胞群的颜色

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问 smart-seq2样本质检报告说有小片段，请问那还可以建库么？

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问 单细胞——小鼠T细胞注释的markers

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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