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单细胞seurat对象的基因过滤

单细胞seurat对象x，在质控(去掉线粒体基因表达比例>10%的细胞等)之后，想去除线粒体基因和核糖体基因等，应该如何操作呢？尝试了如下代码：mito_genes <- grep("^mt-", rownames(x), value = TRUE)
x <- subset(x, features = !rownames(x) %in% mito_genes)没有成功

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standself 注册会员用户来自于: 广东省广州市
2023-05-18 16:52

你的代码有问题啊。应该是 x <- susbet(x, features = features_to_retain) 吧。

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这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2023-05-18 15:39

更新时间: 2023-05-18 17:06

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