怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

2627: 浏览

怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

可变剪切

如题，想寻找EZH2这个基因在患者中的可变剪切形式和对应的表达丰度，不知道用什么软件怎么看呢

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-15 19:31

不同剪切形式，可以用UCSC genome browser去看，比如你说的这个gene [attach]220[/attach] 里面每一行就是1个转录本，就是不同的isoform。至于isoform的定量，现在都不准。你可以用cuffdiff或者stringtie那一套碰碰运气。

赞同 2 1评论

关于作者

: mrfoolish 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-14 11:55

更新时间: 2023-05-17 18:26

关注人数: 4 人关注

相关问题

基因组文件中chrUn具体是什么意思呢: 1838 浏览 0 关注 0 回答 1 评论

不同样品中寻找特异的OTU: 2909 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff: 1563 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？: 3165 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于hub基因的问题: 1456 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

meme寻找大鼠的motif: 2947 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

【求助】怎么能画出子网络图: 1464 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

植物基因组组装过程中如何去除质体序列: 2745 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GEO数据芯片数据基因名转换: 2210 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系: 2599 浏览 2 关注 2 回答 1 评论

推荐内容

问 rMATS是如何得到外显子的两种isform的？: 2469 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026