该问题已被锁定!
2
关注
2425
浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads?是不是多数的chimeric reads都是circRNA的?

查看全部 1 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11
因为测序的时候是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上,所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上。   但是如果是circRNA被测序到,这个测序就会出问题,就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况,当出现这种情况的时候,就是你要的circRNA序列。    

问题动态

发布时间
2018-09-05 12:49
更新时间
2018-09-05 13:11
关注人数
2 人关注

相关问题

如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据?
reads比对的统计
smart-seq2样本质检报告说有小片段,请问那还可以建库么?
求助,安装DESeq2遇到问题
有人有测序中国过去出的非编码rna的视频教程吗
用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图
seqtk的使用技巧,可以处理那些序列问题?
htseqcount和featurecount计数不一样
测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组,miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢?
ATAC-seq不同测序量样本的差异比较
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026