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RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads?是不是多数的chimeric reads都是circRNA的?

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11
因为测序的时候是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上,所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头,切分布在2条链上。   但是如果是circRNA被测序到,这个测序就会出问题,就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况,当出现这种情况的时候,就是你要的circRNA序列。    

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发布时间
2018-09-05 12:49
更新时间
2018-09-05 13:11
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