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异染色质和 Compartment B

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2024-06-12 21:33

严格意义上的异染色质就是指端粒、着丝粒,rDNA区域,这些就是不到10%

后来,随着测序技术的发展,发展了ChIP-seq技术,尤其是组蛋白ChIP-seq,然后就根据组蛋白ChIP-seq信号定义了“开放”和“抑制”。其中开放常用的一些marker有什么active promoter,enhancer之类的,都是用组蛋白定义。相应的,也有用组蛋白去定义染色质抑制区的。

后来这个染色质开放区和抑制区发现和Hi-C的compartment是非常明显的相关,一般B对应抑制区域。

再后来,一些不严格的用法,就是把异染色质和染色质的抑制区域混用了,也就是现在这样。

但非常严格的定义,还应该是染色质不活跃区/染色质抑制区,而不是异染色质。

 

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发布时间
2024-06-12 20:38
更新时间
2024-06-12 21:33
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