3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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【求助】如何确定一种基因ID的类型

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用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗

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当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 关于基因对某种疾病的影响的问题

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问 在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读

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问 infercnv运行报错

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问 关于GO分析的问题

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问 annovar建立非模式物种注释库后怎么分析

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问 请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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问 如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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问 关于基因间的相关性分析

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问 生信问题（我也不知道该怎么问）

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