想要提取指定基因的行信息 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

1426: 浏览

想要提取指定基因的行信息

生物信息学

我已经筛选出了差异表达基因，但是存在一行有很多个基因的现象，比如某一行有RPL13AP5///RPL13AP6///SNORD32A///SNORD33///SNORD34///SNORD35A///RPL13A 所以我想用shell脚本把这样的每个基因弄成一行，试了好多种办法，还是没有达到想要的效果，请问各位前辈有没有什么办法可以提供一下？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市
2018-09-03 14:05

name=`cat /home/Taoct_16/anaysis/ICM/deal/name_deal.txt` for dd in $name do grep $dd 5406.txt >> result1.txt done 这是我提取信息的脚本，其中name_deal.txt是我要提取的所有的基因的名字，5406.txt是我要从中提取的文件

赞同 0 1评论

关于作者

: minipeach 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

10: 回答

0: 文章

16: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-03 14:03

更新时间: 2018-09-03 14:06

关注人数: 1 人关注

相关问题

请问什么是基因组共线性分析？有什么意义？: 1056 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

seurat包，如何调节大热图左侧的基因字体大小: 2634 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于基因对某种疾病的影响的问题: 1119 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因表达芯片的分类问题: 1744 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

验证数据集基因名称: 1394 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？: 1288 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。: 2349 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？: 1672 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何提取可变剪切位点？: 2149 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

sambamba 提取 LITCHI017845的比对情况: 1612 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号: 1836 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于cox回归分析问题: 810 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？: 1902 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 annovar建立非模式物种注释库后怎么分析: 1488 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于GO分析的问题: 1317 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于几个数据库对GO注释的疑问: 1886 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问生存分析KM-plot交叉问题: 2102 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问在单细胞测序中，不同组的T细胞统计检验方法: 2056 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问关于基因间的相关性分析: 1964 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？: 2335 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025