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sambamba使用

生物信息学

zen msambam 提取 LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-09-21 14:27

sambamba是一个用于处理BAM文件的工具，它可以进行排序、索引、过滤、统计和处理比对信息等操作。要使用sambamba提取LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况，你可以使用以下命令： ```bash sambamba view -f bam -F "qname == 'LITCHI017845'" LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam > LITCHI017845.bam ``` 这个命令将根据qname（即reads的名称）筛选出qname为'LITCHI017845'的比对记录，并将结果保存到LITCHI017845.bam文件中。希望这个回答对你有帮助！

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发布时间: 2023-09-21 14:18

更新时间: 2023-09-21 14:27

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