2
关注
842
浏览

sambamba使用

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-21 14:27
sambamba是一个用于处理BAM文件的工具,它可以进行排序、索引、过滤、统计和处理比对信息等操作。要使用sambamba提取LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况,你可以使用以下命令: ```bash sambamba view -f bam -F "qname == 'LITCHI017845'" LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam > LITCHI017845.bam ``` 这个命令将根据qname(即reads的名称)筛选出qname为'LITCHI017845'的比对记录,并将结果保存到LITCHI017845.bam文件中。 希望这个回答对你有帮助!

问题动态

发布时间
2023-09-21 14:18
更新时间
2023-09-21 14:27
关注人数
2 人关注

推荐内容

怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点
smORF的鉴定方法
生存分析KM-plot问题
在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读
根据已知序列查找其第三代基因组编号
根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
翻译序列
如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号
关于几个数据库对GO注释的疑问
annovar建立非模式物种注释库后怎么分析
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024