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这个方案是可行的,并且是常见的处理支原体污染的方法之一。增加测序量可以提高人源细胞系的比对率,使得更多的reads可以正确地映射到人源基因组上。同时,通过剔除支原体reads,可以减少支原体的干扰,使得下游分析更加准确和可靠。
然而,需要注意的是,仅仅通过增加测序量和剔除支原体reads并不能完全解决支原体污染的问题。支原体污染可能来自实验过程中的交叉污染,因此在处理样本和实验操作时需要更加谨慎。此外,为了更准确地评估污染情况,建议进行支原体的定量检测和鉴定,以确定污染的种类和程度。
综上所述,增加测序量并剔除支原体reads是处理ATAC-seq数据中支原体污染的可行方法之一,但仍需要注意实验操作和样本处理的规范性,并结合支原体的定量检测和鉴定来全面评估和解决污染问题。
这家伙很懒,还没有设置简介