前一段时间KEGG接口不是改了吗....clusterprofiler需要更新, 更新后还不行的话, 应该下载离线版的数据库,再进行分析

回答：

出现KEGG和GO结果为空的情况，可能有以下几种原因：

1. 基因集合太小：如果选择的差异基因比较少，可能无法在KEGG和GO数据库中找到足够的注释信息。
2. 注释文件不匹配：在进行KEGG和GO分析之前，需要确保注释文件与转录组数据的版本和物种信息匹配。在本例中，使用的是hg19版本的比对，同时使用gencode.v43lift37.annotation.gtf.gz文件进行计数，因此需要使用相应版本的KEGG和GO数据库进行注释。
3. 基因ID不匹配：如果转录组数据中的基因ID与KEGG和GO数据库中的ID不匹配，那么也会导致结果为空。需要确保使用相同的基因ID进行注释。
4. 显著差异基因的生物学意义较弱：在进行KEGG和GO分析时，需要注意显著差异基因的生物学意义。如果大多数显著差异基因没有明显的生物学意义，那么分析结果可能为空。建议进行更深入的生物学分析，或者增加样本量以提高差异基因的可靠性。

综上所述，出现KEGG和GO结果为空的情况并不一定是正常现象。需要仔细检查数据和注释的匹配性，并进行更深入的生物学分析。

大概率是你输入的gene list名字就有问题。

建议先检查一下gene list的名字。