全基因组关联分析结果与模型选择 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2333: 浏览

全基因组关联分析结果与模型选择

生信具体问题

GWAS分析模型非常多，包括且不限于GLM, MLM, CMLM, MLMM, SUPER, FarmCPU, Blink, LMM等，变换模型对GWAS结果影响大吗？在已经尝试多个模型且结果不太理想情况下，变换模型是否还有意义？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-01 20:52

全基因组关联分析结果与模型选择问题

GWAS分析模型非常多，包括并不限于GLM, MLM, CMLM, MLMM, SUPER, FarmCPU, Blink, LMM等，变换模型对GWAS结果影响非常大。

在已经尝试多个模型且结果不太理想的情况下，变换模型仍然有意义，因为不同模型对不同的数据集和研究问题有不同的优势和适应性。因此，建议在选择模型时，要充分考虑研究问题的特点、数据的性质以及模型的优缺点，尽可能地尝试多种模型，以获得最可靠的GWAS结果。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2023-06-01 20:47

更新时间: 2023-06-01 20:52

关注人数: 2 人关注

相关问题

普通转录组的跨物种分析: 3325 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

请问一下，我的噬菌体基因组fasta文件还是config打头的，是不是需要进一步拼接成scaffold？还是挑选最大的config进行后续分析？: 2279 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于cox回归分析问题: 1266 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

宏基因组注释率超低: 2866 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

cellranger运行结果分析: 2750 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

肿瘤亚型分析: 2426 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗: 2520 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

fusion TWAS 结果报错NA: 3116 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因本体论分析上下调基因差异: 2166 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？: 2919 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 VCONTACT2的结果文件genome_by_genome_overview如何进行统计分类: 3001 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 MCPcounter输入TCGA矩阵的要求？: 2351 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问聚类分析问题: 3235 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 IOBR包输入基因表达矩阵要求: 2433 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？: 4544 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 hmmsearch和hmmscan: 4047 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问群体结构矫正: 2542 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 7011 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问由cutesv流程鉴定到的SV有特别多的缺失基因型: 2371 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Protein-Protein Docking 膜蛋白受体研究: 2718 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026