单细胞RNA-seq分析流程

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID

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xtail分析translation efficiency

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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宏基因组注释率超低

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聚类分析问题

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RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？

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在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？

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宏病毒组做binning分析

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问 请问无参转录组的GO分析如何进行

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问 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map

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问 在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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