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: 无参转录组

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综合问题文章简介

fengling 回复了问题 2018-10-09 09:05 无参转录组: 问答在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

fengling: 那么你现在有的数据是什么格式的文件呢？; 赞同1 反对 0 人感谢 5 评论 3 回复

辅导辅导员的辅导员 发起了提问 2018-09-23 10:45 无参转录组: 问答无参基因组分析GO富集到了这一步不会做

我筛选完差异基因列表，然后也得到转录本对应的GO号如下但是下一步应该是整理这些GO号，大家都用clusterprofile但是我看了mannual发现用的ID要求的embl，所以。。下一步怎么整理求帮助 [attach]257[/attach] :; 关注问题 1  0  0 评论

ccssooll999 发起了提问 2018-08-31 09:16 无参转录组 软件使用: 问答 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map

有没有用过 SOAPdenovo-Trans 组装的，求助如何获得 gene_trans_map ，就是 Trinity 组装产生的那个，感谢大佬☺:; 关注问题 1  0  0 评论

孟浩巍 回复了问题 2018-08-28 10:35 GO分析 无参转录组: 问答请问无参转录组的GO分析如何进行

孟浩巍: 现在blast2GO商业化了，有钱可以用，挺好用的。如果没有钱的话，一般是注释GO id以后用topGO做富集分析~ 回头我专门写一个帖子讲这个事情。; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 6 回复

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