什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1586: 浏览

什么是nomalized read count，和RPKM是什么关系

转录组比对

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:17

楼上你说的……有点问题的…… [size=14]normalized read count 主要是对测序量进行校正，比如1个case测了10M，1个case测了20M。最简单的办法就是直接对case 2 除以2，但是真实算的时候不是这么算的，有不同的方法。理由是，基因的表达量不是线性变化的。[/size]

赞同 1 1评论

小赛尔注册会员用户来自于: 广东省
2018-09-07 23:27

已解决，normalized read count是read除以片段长度除以总read数，与RPKM可直接换算。

赞同 0 0评论

关于作者

: 小赛尔 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

3: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-07 13:13

更新时间: 2018-09-08 10:17

关注人数: 2 人关注

相关问题

想问问大家有熟悉分子对接的吗，想问问蛋白-蛋白对接需要什么软件与操作: 1184 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

NIPT算出了z-score后想要基于z>3的值对Z值进行校正该用什么方法: 1528 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

想画一个染色体类似于条形码的图，大家有什么建议: 1411 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重？: 1661 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？: 1322 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？: 1157 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义: 953 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图: 1028 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GWAS和WGS的选择消除分析有什么区别呀？: 1261 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

单细胞数据的多个lib是什么意思呢？: 877 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问不同比对软件出的结果能进行比较吗？: 1152 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1175 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 reads比对的统计: 995 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025