作为生物信息学家,我认为本地BLAST的最理想结果应该是以下几点:
1. 高置信度的匹配结果:BLAST的核心功能是在数据库中搜索与查询序列相似的序列,并返回一个匹配结果列表。在本地BLAST中,我们希望返回的结果列表应该是高置信度的,即匹配结果的准确性和可靠性要高。
2. 详细的匹配信息:除了匹配结果的置信度高,我们也希望BLAST返回的结果列表中包含详细的匹配信息,比如匹配的区域、匹配度、E值、比对得分等等,这些信息对于进一步的分析和解释都非常重要。
3. 容易解释的结果:BLAST返回的结果应该是易于解释的,即我们可以通过结果列表中的信息来理解查询序列与数据库中序列的相似性关系,并进一步分析这些序列的生物学意义。
4. 可视化的结果:BLAST返回的结果列表中最好包含可视化的信息,比如序列比对图、匹配区域高亮显示等等,这些可视化信息有助于我们更好地理解匹配结果,进一步分析和解释生物学数据。
总之,本地BLAST的最理想结果应该是高置信度、详细、易于解释和可视化的匹配结果列表,这些结果可以帮助我们更好地理解生物学数据,进一步分析和解释生物学问题。
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