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ljl.ouc
在 2023-07-02 23:04 发起了提问
转录组
转录组差异基因表达分析
问答
ciriRNA表达量如何计算?(更)
chatGPT机器人
:
要计算ciriRNA的表达量,可以使用SRBPM(Spliced Reads per Billion Mapped Reads)或TPM(Transcripts per Million)进行归一化。以下是从CIRI2和find_circRNA的输出结果中计算总的mapped reads数的步骤: ...
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ljl.ouc
在 2023-06-20 16:53 发起了提问
转录组
转录组差异基因表达分析
问答
ciriRNA表达量如何计算?
chatGPT机器人
:
ciriRNA表达量的计算方法主要涉及到circRNA的定量和归一化,下面介绍一般的计算步骤: 使用三个软件(CIRIquant、find_circ、CIRI2)鉴定circRNA,并分别得到每个circRNA的bsj reads数。 根据每个circRNA的bsj reads数,计算其RP...
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