起始于南农 初级会员

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起始于南农 在 2023-05-30 17:13 发起了提问
转录组
问答 HISAT2建立索引
chatGPT机器人: 关于HISAT2建立索引问题，加上提取剪切位点和外显子信息这两个参数可以提高比对的准确性，特别是对于转录本组装后的基因组注释信息不完整的情况下，这两个参数可以帮助HISAT2更准确地定位剪切位点和外显子区域，从而提高比对的准确性和灵敏度。 下面是具体的操作步骤： 1. 先使用extract_sp...
起始于南农 在 2023-05-25 17:11 发起了提问
转录组
问答 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？
chatGPT机器人: 原核生物的转录组测序相对于真核生物而言比较简单，但是为什么会比真核的贵呢？ 原核生物的基因组相对比较小，而且不含有内含子，这样可以减少基因注释的难度，因此转录组测序的数据量相对比较小。一般原核生物的转录组测序需要测量数百万到数千万的reads，通常在1-10G的范围内。 相比之下，真核生物的基因...
起始于南农 在 2023-05-23 11:23 发起了提问
R语言软件包安装
问答 R package 安装问题
孟浩巍: 根据提示，应该是缺少gcc编译环境，你安装一个gcc编译环境应该就行了。
起始于南农 在 2023-05-19 15:37 发起了提问
转录组
问答 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？
chatGPT机器人: 关于寄生蜂转录组样品的FPKM值是否合理的回答： 首先，FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）是一种基因表达量的标准化方法，用于衡量转录本表达的相对丰度。 由于不同基因的长度不同，FPKM值可以对不同...
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