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: kegg功能注释

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综合问题文章简介

lconan 回复了问题 2023-06-15 09:44 GO分析 kegg功能注释: 问答 KEGG结果为空？

lconan: 前一段时间KEGG接口不是改了吗....clusterprofiler需要更新, 更新后还不行的话, 应该下载离线版的数据库,再进行分析; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

ForceAres 回复了问题 2023-05-24 15:39 GO分析 kegg功能注释: 问答 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的

ForceAres: 根据Clusterprofile里面表的默认排序，存在@result里面，查阅源码可知，这个表的默认排序是似乎是根据pavlue来的; 赞同1 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-02 10:33 kegg功能注释: 问答请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

孟浩巍: 其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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