请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1706: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

想问问大家有熟悉分子对接的吗，想问问蛋白-蛋白对接需要什么软件与操作: 1821 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢: 2463 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？: 2996 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问一下，如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢？: 1575 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？: 2739 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

请问一下大家生物信息学的生物学具体应用: 1889 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本: 1909 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为什么我的R count用不了呢？: 3061 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？: 1912 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问cytoscape是怎么构建网络的？: 1750 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 KEGG结果为空？: 3224 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 3332 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025