整合scRNA和scATAC相关问题请教

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在用seurat做多样本整合的时候的问题

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gbff格式转为gff格式。合并的gff格式需要分开

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单细胞多样本熵分析样例代码

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ATAC-seq样本重复数

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肿瘤样本的VAF值

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ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）

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问 使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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问 在做RNA Velocity的时候增殖细胞群总是起点

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问 你好chatGPT,可以提供包含双细胞去除的单细胞分析完整流程吗？

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问 singularity查到不到指定输入文件位置

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问 单细胞seurat对象的基因过滤

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问 单细胞转录因子

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问 Monocle3绘制自定义轨迹错误

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问 infercnv运行报错

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问 seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞

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