bulk-RNAseq数据集整合

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为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重？

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根据Barcode序列进行样本拆分？

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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转录组组内样本差异大

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关于DESeq2样本聚类的问题

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请教多个scRNA样本整合问题

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harmony处理批次效应

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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问 单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？

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问 singularity查到不到指定输入文件位置

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问 infercnv运行报错

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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问 harmony处理批次效应

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问 单细胞转录因子

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问 samtools view筛选cellranger比对结果

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问 如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？

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问 在做RNA Velocity的时候增殖细胞群总是起点

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问 你好chatGPT,可以提供包含双细胞去除的单细胞分析完整流程吗？

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