该问题已被锁定!
2
关注
1454
浏览

celseq2转换单细胞原始数据

查看全部 2 个回答

liuzj039 注册会员 用户来自于: 广东省
2023-06-06 11:18

你倒是说一声你用什么跑的啊。

Starsolo,UMItools什么都能跑。

我之前用的celseq2他们自己的pipeline,https://github.com/yanailab/celseq2。拿到的就是每个Library的csv格式或者pandas h5格式的mtx,直接正常读取就行。 

关于作者

Han1024 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-05-29 16:18
更新时间
2023-06-06 11:18
关注人数
2 人关注

推荐内容

请教多个scRNA样本整合问题
运行harmony后counts数变成小数
使用seurat包,导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc
DoubletfFinder Pk值相关计算的问题
整合scRNA和scATAC相关问题请教
seurat包,如何调节大热图左侧的基因字体大小
monocle3中plot_cells更改其画出来的细胞群的颜色
harmony整合样本前需要分别预处理吗?
单细胞多样本熵分析样例代码
seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025