使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图

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想问问大家有熟悉分子对接的吗，想问问蛋白-蛋白对接需要什么软件与操作

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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什么是EWAS？有没有推荐的EWAS推荐教程？

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请问一下大家生物信息学的生物学具体应用

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ChIP-seq测序深度

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Chip-seq bam文件的处理

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是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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RIP-seq有没有类似ChIP-seq的blacklist region合集？

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想画一个染色体类似于条形码的图，大家有什么建议

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问 sc-ATAC数据质控

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问 关于生存分析的问题

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问 关于基因间的相关性分析

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问 tophat报错 & cufflinks安装报错

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问 ggtree可视化NJ树

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问 从bed文件获取注释

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问 生信问题（我也不知道该怎么问）

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问 XP-CLRp

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问 关于hub基因的问题

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