关于DESeq2样本聚类的问题

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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关于拟南芥着色粒附近的变异数量

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根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff

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小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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获取所有基因的转录起始位点（TSS）

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用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗

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问 riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

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问 想要提取指定基因的行信息

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问 生信到底如何入门？？？

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问 smORF的鉴定方法

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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问 关于cox回归分析问题

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问 根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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问 annovar建立非模式物种注释库后怎么分析

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问 infercnv运行报错

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问 生信问题（我也不知道该怎么问）

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