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关于RSEM和RPKM

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-04 14:21
癌症的数据尤其是TCGA的数据现在都是给RSEM,大家目前测序常用的还是FPKM,RPKM,TPM。   个人观点是RSEM的缺点在于不直观,优点是通过机器学习的办法处理了一些因素,而不是像FPKM,RPKM,TPM这些,线性处理所有的情况。   我个人的观点是,癌症数据大家现在都用RSEM,那么我也建议你用RSEM; 但是自己的RNA-Seq数据,我还是建议用FPKM,RPKM,TPM,这个系列的。

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发布时间
2018-08-29 16:24
更新时间
2018-09-04 14:21
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