rna-seq数据校正 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1652: 浏览

rna-seq数据校正

生信问题

请问，rna-seq数据处理完之后发现gapdh的值差异较大，可以通过gapdh来校正其它基因的表达量吗？

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-27 14:39

一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。

赞同 2 0评论

关于作者

: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

5: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-26 09:49

更新时间: 2018-09-27 15:04

关注人数: 2 人关注

相关问题

prokka数据库更新: 1537 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？: 1941 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性: 1706 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

单细胞数据的多个lib是什么意思呢？: 1128 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？: 1520 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GEO数据读入: 1158 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

linux bam数据替换: 1929 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？: 1803 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因: 1879 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？: 1671 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问关于GO分析的问题: 1225 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？: 2109 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何批量下载SRA数据库中的数据？: 1903 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 1651 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 2285 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 1771 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 bcl2fastq2安装问题: 1978 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？: 1726 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025